Az Insomniac Games máris hozzányúlt a Marvel's Wolverine egyik legtöbbet kritizált megoldásához. A szeptember 19-én kiadott 1.001.005-ös frissítés csökkenti a Logan szaglását megjelenítő Scent Trails, valamint az Audio Sense jelzéseinek átlátszatlanságát, így azok kevésbé feltűnően jelennek meg a képernyőn. A stúdió közölte, hogy tovább vizsgálja a rendszer átalakításának lehetőségeit, és egy későbbi frissítésben akár külön kapcsolóval is ki-be kapcsolhatóvá teheti ezeket a vizuális segítségeket.
A szagcsíkok már a megjelenés előtt és közvetlenül utána is komoly vitát váltottak ki. A játék bizonyos pontokon egy jól látható kékes nyomvonallal jelzi, merre vezet egy adott szag, vagy hol található a következő célpont, nyom vagy gyűjthető tárgy. Mivel a Marvel's Wolverine alapvetően lineáris játék, sokan túlzott segítségnek érezték ezt, a látványos effektust pedig az interneten hamar "fingfelhőként" kezdték emlegetni.
A mostani frissítés egyelőre nem távolítja el teljesen a rendszert, csak kevésbé hangsúlyossá teszi. Az Insomniac korábban azzal indokolta a megoldást, hogy Logan rendkívül fejlett érzékei a karakter képességeinek fontos részét képezik, így a szaglás és a hallás vizuális megjelenítése tudatos játékmeneti elem. A játékosok visszajelzései alapján azonban a stúdió láthatóan hajlandó finomítani rajta.
Az 1.001.005-ös hotfix nemcsak ezen változtatott. A fejlesztők több olyan összeomlást is javítottak, amelyek a megjelenés óta a játékosok kis részénél jelentkeztek. Az Insomniac egyelőre nem árulta el, mikor érkezhet az a frissítés, amely már teljesen kikapcsolhatóvá tenné az érzékeléshez kapcsolódó vizuális jelzéseket.